Co-designing sequence and structure of functional de novo enzymes with EnzyGen2

저자: | 날짜: 2026-03-02 | URL: https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.03.02.709205v2 📄 PDF

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Essence

Figure 1

Fig. 1 Overview of EnzyGen2 and the curated protein-ligand dataset.

EnzyGen2는 단백질-리간드 상호작용을 명시적으로 고려하여 서열과 구조를 동시에 설계하는 7억 3천만 파라미터의 단백질 파운데이션 모델이다. 720,993개의 단백질-리간드 쌍으로 학습하여 클로람페니콜 아세틸트랜스퍼라제 등 다중 효소에서 51.6% 서열 동일성으로도 자연 효소 수준 이상의 촉매 활성을 갖는 신규 효소를 생성한다.

Motivation

Achievement

Figure 2

Fig. 2 In silico evaluation results and ablation analysis of EnzyGen2. a, The pretrained EnzyGen2 outper-

EnzyGen2의 주요 성과:

How

Figure 1

Fig. 1 Overview of EnzyGen2 and the curated protein-ligand dataset.

Originality

Limitation & Further Study

Evaluation

Novelty: 4/5 Technical Soundness: 5/5 Significance: 5/5 Clarity: 5/5 Overall: 5/5

총평: EnzyGen2는 단백질-리간드 상호작용을 명시적으로 통합한 강력한 파운데이션 모델로, 광범위한 학습 데이터와 혁신적 아키텍처로 단백질 설계 분야에 실질적 돌파구를 제시하며, 다중 효소 패밀리에 걸친 실험 검증으로 높은 신뢰성을 확보한다.

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